Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOPXQ9BPY8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOPXQ9BPY8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms