Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80bQ99PT3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80bQ99PT3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80bQ99PT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms