Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh23Q99PF4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh23Q99PF4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh23Q99PF4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh23Q99PF4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh23Q99PF4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.8 ms