Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem2Q99NH8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem2Q99NH8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trem2Q99NH8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms