Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Pcgf6Q99NA9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcgf6Q99NA9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pcgf6Q99NA9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms