Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl43Q99N89 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl43Q99N89 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms