Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SrrtQ99MR6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrrtQ99MR6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrrtQ99MR6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms