Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PtprtQ99M80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PtprtQ99M80 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprtQ99M80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PtprtQ99M80 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PtprtQ99M80 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprtQ99M80 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
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