Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pagr1aQ99L02 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pagr1aQ99L02 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pagr1aQ99L02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1aQ99L02 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms