Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf34Q99KR6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf34Q99KR6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf34Q99KR6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.4 ms