Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Higd1bQ99JY6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms