Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YME1L1Q96TA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
YME1L1Q96TA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms