Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC44.52■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
RSF1Q96T23 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
RSF1Q96T23 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
RSF1Q96T23 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
RSF1Q96T23 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms