Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SECISBP2Q96T21 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SECISBP2Q96T21 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SECISBP2Q96T21 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms