Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SIN3AQ96ST3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SIN3AQ96ST3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SIN3AQ96ST3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SIN3AQ96ST3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1180.3 ms