Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf49Q96NF6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms