Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA13Q96N96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA13Q96N96 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA13Q96N96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA13Q96N96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA13Q96N96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA13Q96N96 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms