Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00167Q96N53 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00167Q96N53 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms