Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD2Q96M20 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNBD2Q96M20 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms