Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM47Q96LD4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM47Q96LD4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM47Q96LD4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms