Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCZQ96LD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCZQ96LD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms