Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARK4Q96L34 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARK4Q96L34 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK4Q96L34 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARK4Q96L34 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms