Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00208Q96KT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms