Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PRAC1Q96KF2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PRAC1Q96KF2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms