Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC136Q96JN2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC136Q96JN2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms