Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.17■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
JPH4Q96JJ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.05■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.04■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
JPH4Q96JJ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
JPH4Q96JJ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
JPH4Q96JJ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms