Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM46AQ96IP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46AQ96IP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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