Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC124Q96CT7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC124Q96CT7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC124Q96CT7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC124Q96CT7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms