Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NSUN4Q96CB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSUN4Q96CB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSUN4Q96CB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms