Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf43Q96C57 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf43Q96C57 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms