Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKD2Q969F2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKD2Q969F2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms