Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATA6Q92908 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms