Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT9Q92600 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT9Q92600 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT9Q92600 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.8 ms