Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3S1Q92572 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3S1Q92572 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms