Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrif1Q923B3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrif1Q923B3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms