Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NelfcdQ922L6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NelfcdQ922L6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NelfcdQ922L6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms