Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mthfd1Q922D8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mthfd1Q922D8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mthfd1Q922D8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mthfd1Q922D8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms