Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca5Q91ZW3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca5Q91ZW3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca5Q91ZW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms