Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atpaf2Q91YY4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atpaf2Q91YY4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpaf2Q91YY4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atpaf2Q91YY4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms