Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp1bQ91YK2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1bQ91YK2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1bQ91YK2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms