Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec16bQ91XT4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec16bQ91XT4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec16bQ91XT4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec16bQ91XT4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms