Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp9Q91WM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp9Q91WM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp9Q91WM3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms