Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pqbp1Q91VJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pqbp1Q91VJ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pqbp1Q91VJ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pqbp1Q91VJ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pqbp1Q91VJ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pqbp1Q91VJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pqbp1Q91VJ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pqbp1Q91VJ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms