Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CSRNP3Q8WYN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CSRNP3Q8WYN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CSRNP3Q8WYN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CSRNP3Q8WYN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CSRNP3Q8WYN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CSRNP3Q8WYN3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CSRNP3Q8WYN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CSRNP3Q8WYN3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms