Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PYDC1Q8WXC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PYDC1Q8WXC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYDC1Q8WXC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms