Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF31Q8WWY3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF31Q8WWY3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF31Q8WWY3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms