Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFT2D1Q8WV19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D1Q8WV19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SFT2D1Q8WV19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms