Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIB5

Barhl2, BarH-like 2 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl2Q8VIB5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Barhl2Q8VIB5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Barhl2Q8VIB5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms