Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps4aQ8VEJ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps4aQ8VEJ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 373.7 ms