Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmcd1Q8VEE1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmcd1Q8VEE1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms